由于二級結構或者其它內在因素的影響，復雜結構對于測序是巨大的挑戰。常規的測序方案往往容易出現提前中斷或者測序結果紊亂的現象。

以下幾種序列特點的樣品適合針對復雜結構的測序方案：

高GC含量：GC含量>60%的模板，或者局部高GC含量的模板

發夾結構：包含兩個反向重復序列，兩個重復序列之間間隔至少3個堿基

重復序列：2個或3個堿基的多個連續重復。

DNA發卡結構及RNAi 模板測序

RNA干擾（RNAi）是指雙鏈RNA（dsRNA）介導的特異性抑制某相關基因表達的一種機制。它逐漸發展為一種研究基因功能的快速有效的新興技術。

RNAi模板，由于其存在 “發卡結構”，給測序工作帶來了很大挑戰。在RNAi研究中采用的小發卡RNA（shRNA）通常無法測序成功，測序結果往往提前中斷或者信號紊亂。強耀生物擁有專門針對shRNA模板的測序方案，測序結果得到客戶的一致認可。

強耀生物的測序方案可以對環狀基因組的噬菌體（噬菌體上清或者噬菌斑）直接測序。當難以獲得足夠量的測序用噬菌體DNA樣品時，該操作為您省掉DNA制備的繁瑣過程，并能獲得高質量的測序結果。

本項服務包括:

·節約時間和成本-無需菌液培養和DNA制備

·ABI3730xl DNA序列分析儀進行序列分析

·Phred20有效長度大于600bp

·免費提供強耀生物通用引物

·您可以選擇在線提交訂單，強耀生物CLIMS系統將長期保存您的訂單信息以及測序結果:

·強耀生物的技術支持會針對項目中的問題及時與您溝通

強耀生物可以通過Primer Walking測序，幫助您獲得未知克隆的序列信息，或者驗證克隆序列的準確性。如果您提供參考序列，我們可以一次完成長片段克隆的全長測序。

本項服務包括:

·引物設計并合成

·根據序列圖譜進行人工編輯

·序列拼接

·發送拼接序列結果